Vedenie spoločnosti Krka sa spolieha na odhodlanie, zodpovednosť a jasnú víziu, aby viedlo zamestnancov k plneniu cieľov a poslania spoločnosti. Komplexné obchodné procesy riešime transparentným spôsobom, ktorý si vyžaduje úzku a intenzívnu spoluprácu zamestnancov.
Riadenie spoločnosti Krka je založené na dvojstupňovom systéme. Spoločnosť riadi predstavenstvo, zatiaľ čo jej činnosť kontroluje dozorná rada. Správa a riadenie spoločnosti vychádza z právnych predpisov Slovinskej republiky, slovinskej a medzinárodnej správnej praxe, verejne dostupnej Politiky správy a riadenia spoločnosti a jej interných pravidiel.